https://www.arduino.cc/en/Main/Software, scaricare l’ultima versione Linux per Arduino YUN, unzip e copiare la bin su una scheda micro SD. Inserire la micro nello YUN.
Collegarsi allo YUN con il terminale: ssh root@arduino.local (arduino=il nome del dispositivo), password (arduino, se nuovo), run-sysupgrade /mnt/sda1/il nome della bin.

Upgrade: https://www.arduino.cc/en/Tutorial/YunSysupgrade,
Installare PHP: http://www.lucadentella.it/2013/12/05/yun-utilizzare-php/
Installare FTP: http://keepingitgreen.salmashups.com/p/using-ftp.html